محمد نصرتی در فصل نقل و انتقالات با استقلال قرارداد داخلی امضا کرد اما به این قرار داد پایبند نبود و در نهایت قراردادش را با پرسپولیس در هیئت فوتبال تهران ثبت کرد.
به دنبال این موضوع باشگاه استقلال از این بازیکن به کمیته انضباطی شکایت کرد و کمیته انضباطی هم طبق قانون نصرتی را به پرداخت ۵۰ درصد از قراردادش یعنی ۲۰۰ میلیون تومان به عنوان غرامت به باشگاه استقلال محکوم کرد.
فتح الله زاده سرپرست باشگاه استقلال در این باره به فارس گفت: طبق نامه رسمی که سازمان لیگ به باشگاه استقلال ارسال کرده این پول از منبع درآمد باشگاه پرسپولیس در سازمان لیگ به باشگاه استقلال داده می شود.